Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А.

Нажмите для полного просмотра!

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №2

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №3

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №4

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №5

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №6

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №7

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №8

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №9

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №10

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №11

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №12

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №13

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №14

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №15

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №16

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №17

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №18

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №19

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №20

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №21

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №22

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №23

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №24

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А., слайд №25

Содержание ▲

Вы можете ознакомиться и скачать презентацию на тему Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А.. Доклад-сообщение содержит 25 слайдов. Презентации для любого класса можно скачать бесплатно. Если материал и наш сайт презентаций Mypresentation Вам понравились – поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте в закладки в своем браузере.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1

Описание слайда:

Программирование внутриклеточных реакций Белецкий Б. А.

Слайд 2

Описание слайда:

Успехи вычислительной биологии 1944 – E. Schrodinger «What is life? The Physical Aspect of the Living Cell» 1948 – самовоспроизводящиеся автоматы фон-Неймана 1952 – A.M. Turing “The Chemical Basis of Morphogenesis” 1953 – открытие структуры ДНК 1958 – впервые найдена высокоточная пространственная структура белка 1958 – сформулирована основная догма молекулярной биологии: ДНК->РНК->Белок 1968 – расшифровка генетического кода

Слайд 3

Описание слайда:

Успехи вычислительной биологии 1970 - … последовательности однотипных объектов исследуются при помощи ЭВМ: ДНК/РНК (A,C,G,T/U) белки (A,R,N,D,C,E,Q,G,H,I,L,K,M,F,P,S,T,W,Y,V) 1972 – появляются открытые банки белковых структур (wwPDB - 77000 записей) 1977 – секвенирование первого полного генома (фаг ФХ174, 5386 н., 11 белков) 1977 – открытые банки данных геномов (NCBI) высшие организмы (859) низшие организмы (3147) вирусы (2879)

Слайд 4

Описание слайда:

Успехи вычислительной биологии 1990 – S. Altschul, W. Gish, W. Miller, E. Myers, D. Lipman (October 1990). “Basic local aligment search tool” (BLAST) 2001 – секвенирование полного генома человека (3,2 млрд. н., 25 тыс. белков) 2004 – Luka Cardelli “Bioware Languages” 2008 – А.М. Гупал, И.В. Сергиенко «Оптимальные процедуры распознавания» 2010 – создание искусственной бактерии Mycoplasma Laboratorium (0,5 млн. н., 382 гена) 2010 – Ю.М. Романовский, А.Н. Тихонов «Молекулярные преобразователи энергии живой клетки. Протонная АТФ-синтаза — вращающийся молекулярный мотор» УФН 2011 – G. Chaitin “Life as evolving software”

Слайд 5

Описание слайда:

Вирус иммунодефицита человека Геном вируса иммунодефицита человека представлен двумя идентичными молекулами РНК, каждая из которых имеет длину чуть меньше 10000 нуклеотидов. Всего геном вируса включает 9 генов. Они кодируют 15 различных белков. Всего использовалось 17 белков.

Слайд 6

Описание слайда:

Внутренняя жизнь клетки BioVisions - Inner Life of the Cell

Слайд 7

Описание слайда:

Результаты Autonomy Labs как собрать коробки вместе очень простые роботы как отсортировать камни по размеру С.С. Хилькевич «Физика вокруг нас» Что происходит при встряхивании (с. 61), вибросепарация

Слайд 8

Описание слайда:

Сравнение живой клетки и ЭВМ Клетка

Слайд 9

Описание слайда:

Сравнение живой клетки и ЭВМ Клетка

Слайд 10

Описание слайда:

Программирование при помощи частиц Взаимодействия между частицами задаются алгоритмически, природа взаимодействий не изучается Частицы обладают зарядами, которые позволяют уточнять взаимодействия Составные частицы наследуют характеристики своих составляющих Характеристики частицы зависят от ее структуры Структуру частицы можно описать в виде линейной последовательности символов конечного алфавита Java->Scala

Слайд 11

Описание слайда:

Алфавит Множество базовых частиц Множество связок вида Алфавит определяется индуктивно: ; где , ; ничто другое не является элементом . Линейное представление частицы: Представление в виде бинарного дерева:

Слайд 12

Описание слайда:

Конфигурация Множество положений частицы в системе: , Конфигурация: Отношение соседства: Путь длиной : , Расстояние - длина кратчайшего пути между позициями и ; , если такого пути не существует Окружение:

Слайд 13

Описание слайда:

Взаимодействия Взаимодействие: Взаимодействие составных частиц: Радиус действия: , , Пример: случайное блуждание

Слайд 14

Описание слайда:

Напряженность Напряженность: Напряженность базовой частицы Радиус действия: Напряженность составных частиц: Энергия конфигурации:

Слайд 15

Описание слайда:

Динамика системы Процедура , Выбрать с равномерной вероятностью Вычислить Вычислить Если , то Если , то Исходная конфигурация:

Слайд 16

Описание слайда:

Функция перехода Функция перехода : Выбор новой конфигурации : Принятие/отклонение выбранной конфигурации : Функция перехода за несколько шагов:

Слайд 17

Описание слайда:

Состояние Состояние системы , : Изменение состояния под действием : Равновесное состояние :

Слайд 18

Описание слайда:

Модель Модель: - алфавит - множество позиций - отношение соседства - напряженность - взаимодействие - начальная конфигурация Достижимые конфигурации, : Взаимно достижимые: Множество достижимых конфигураций модели :

Слайд 19

Описание слайда:

Теорема 1 Пускай - модель системы, - множество достижимых конфигураций модели, и выполняются условия: , ; ; , . Тогда имеет единственное равновесное состояние , причем:

Слайд 20

Описание слайда:

Теорема 2 Пускай выполняются условия Теоремы 1, тогда можно указать такое число , что вероятность нахождения частицы на позиции при фиксированных частицах на позициях . в равновесном состоянии не зависит от частиц, находящихся на позициях .

Слайд 21

Описание слайда:

Примеры Случайное блуждание Притяжение/отталкивание Составные заряды Формирование связи Взаимодействие, зависящее от заряда Реакция Белоусова-Жаботинского Рибосома и мРНК