Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс

Нажмите для полного просмотра!

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №2

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №3

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №4

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №5

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №6

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №7

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №8

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №9

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №10

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №11

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №12

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №13

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №14

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №15

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №16

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №17

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №18

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №19

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №20

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №21

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №22

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №23

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №24

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №25

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №26

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №27

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №28

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №29

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №30

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №31

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №32

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №33

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №34

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №35

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс, слайд №36

Содержание ▲

Вы можете ознакомиться и скачать презентацию на тему Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс. Доклад-сообщение содержит 36 слайдов. Презентации для любого класса можно скачать бесплатно. Если материал и наш сайт презентаций Mypresentation Вам понравились – поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте в закладки в своем браузере.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1

Описание слайда:

Системная биология – сети М.Гельфанд «Сравнительная геномика» БиБи 4 курс

Слайд 2

Описание слайда:

разные сети белок-белковые взаимодействия регуляторные сети (фактор-ген) метаболические

Слайд 3

Описание слайда:

свойства сетей N = количество вершин распределение степеней вершин P(k) = вероятность того, что у случайно взятой вершины будет k ребер средняя длина пути между вершинами L

Слайд 4

Описание слайда:

случайная сеть пуассоновское распределение P(k) = exp(-λ) λk / k! Теорема Эрдеша-Реньи: фазовый переход – возникновение гигантской компоненты средняя длина пути ~ log N

Слайд 5

Описание слайда:

scale-free network P(k) ~ k–γ γ>3 – ничего особенного 2

Слайд 6

Описание слайда:

Random and scale-free P(k) (linear and log scales)

Слайд 7

Описание слайда:

Коэффи-циент класте-ризации Мера связи между соседями данной вершины

Слайд 8

Описание слайда:

примеры белок-белковые взаимодействия синтетические летали регуляция транскрипции метаболические сети

Слайд 9

Описание слайда:

Yeast protein interaction network

Слайд 10

Описание слайда:

Слайд 11

Описание слайда:

Гигантская компонента в графе белок-белковых взаимодействий в дрожжах Красный – летальная мутация Оранжевый – медленный рост Желтый – неизвестно Зеленый – нелетальная мутация

Слайд 12

Описание слайда:

Белок-белковые взаимодействия в дрожжах: P(k) и размеры связных компонент

Слайд 13

Описание слайда:

Synthetic lethals in yeast

Слайд 14

Описание слайда:

Rank vs. degree for metabolites and reactions in Helicobacter pylori

Слайд 15

Описание слайда:

Transcription regulatory network in baker’s yeast

Слайд 16

Описание слайда:

регуляция транскрипции (дрожжи, ChIP-chip) A: in-degree (относительно регулируемых генов): гистограмма (в полулогарифмических координатах) количества промоторов с заданным числом регуляторов– экспоненциальное распределение (у большинства генов мало регуляторов). Пустые кружки – случайный граф В: out-degree (относительно факторов): гистограмма количества факторов, связывающих заданное количество промоторов – scale-free

Слайд 17

Описание слайда:

Transcription regulatory network in Homo Sapiens

Слайд 18

Описание слайда:

Transcription regulatory network in E. coli

Слайд 19

Описание слайда:

зависимость физиологических и геномных свойств от топологии дрожжи: ~10% genes with 60% genes with >15 links are essential гены с большим числом связей с большей вероятностью имеют ортологов в многоклеточных эукариотах ближе к ортологам из C. elegans

Слайд 20

Описание слайда:

party hubs и date hubs Бимодальное распределение корреляций уровня экспрессии Красный: hubs Голубой: non-hubs Черный: случайный граф Party hubs: сам и соседи ко-экспрессируются (комплексы) Date hub: нет корреляции в уровнях экспрессии (сигнальные пути)

Слайд 21

Описание слайда:

Устойчивость к атаке (распадение гигантской компоненты) основа сети – party hubs Красный: атака на party hubs Коричневый: атака на все хабы Голубой: атака на date hubs Зеленый: атака на случайные белки

Слайд 22

Описание слайда:

мотивы клики много в графах белок-белковых взаимодействий (масс-спек. анализ комплексов – по определению) подграфы фиксированной структуры, встречающиеся существенно чаще, чем в случайном графе (с теми же свойствами)