Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD

Нажмите для полного просмотра!

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №2

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №3

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №4

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №5

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №6

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №7

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №8

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD, слайд №9

Содержание ▲

Вы можете ознакомиться и скачать презентацию на тему Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD. Доклад-сообщение содержит 9 слайдов. Презентации для любого класса можно скачать бесплатно. Если материал и наш сайт презентаций Mypresentation Вам понравились – поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте в закладки в своем браузере.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1

Описание слайда:

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики. Программа XMD

Слайд 2

Описание слайда:

Научные программы, реализующие метод молекулярной динамики (только примеры, а не полный список)

Слайд 3

Описание слайда:

Программа XMD Автор: Джон Рифкин (John Rifkin), Университет штата Коннектикут (США) Используемые потенциалы: метод погруженного атома для металлов, Стиллингера-Вебера для Si, Терсоффа для С, Si

Слайд 4

Описание слайда:

Синтаксис использования Командное окно Windows (можно использвать FAR manager) > xmd xmd.in xmd.in – файл, содержащий команды XMD и вводящий типы и координаты частиц, потенциалы, определяющий условия моделирования и т.д., то есть, составляемый пользователем и управляющий расчетами название, расширение командного файла могут быть любыми, например, ilike.md, my.txt и т.п.

Слайд 5

Описание слайда:

Ввод основных параметров моделирования MASS 58.7 (масса атомов в а.е.м.) DTIME 5.e-15 (шаг времени в сек) EUNIT uname, uname=erg, joule, K, eV READ filename (чтение команд с файла) READ чаще всего используется для ввода информации, имеющей самостоятельное значение: таблиц с потенциалами, исходных координат и скоростей частиц, например, READ ni.ptf и READ ni.in). Здесь также названия и расширения файлов, с которых считывается информация, могут быть любыми.

Слайд 6

Описание слайда:

Ввод начальных координат и расчетной ячейки READ coord.in # Файл coord.in содержит следующую информацию: POSITION 3 1 0.24E-01 0.76E+02 0.88E+00 1 0.52E-01 0.16E+02 0.11E+00 1 0.34E+00 0.76E+01 0.88E+01 # тип X Y Z # 0

Слайд 7

Описание слайда:

Таблица потенциалов МПА eunit eV potential set eam 1 potential embed 1 500 0.000000 0.250000 0.000000000000000E+00 -0.505170160489967E+00 -0.793178538482671E+00 -0.102174385870394E+01 -0.121748056902693E+01 -0.139157085043753E+01 …………………. potential pair 1 1 499 0.009697 4.838788 0.145411794129883E+06 0.713742661881313E+05 0.466632980925746E+05 …………………. potential dens 1 500 0.000000 4.838788 0.000000000000000E+00 0.590101261981482E-04 0.951200176593089E-03 ………………….

Слайд 8

Описание слайда:

Параметры, определяющие условия моделирования ITEMP temp CLAMP temp [cstep] PRESSURE CLAMP bulkmodulus [cstep] # Bulkmodulus in 1 Мбар=0,1 ТПа PRESSURE EXTERNAL pX [ pY pZ ]

Слайд 9

Описание слайда:

Режимы моделирования QUENCH nstep [nquench=1,2] CMD nstep repeat 10 cmd 100 quench 200 End ESAVE nskip file WRITE FILE [+]filename QUANTITY QUANTITY=BOX,EATOM,STRESS,PARTICLE WRITE PDB file