🗊Презентация UCSC Genome Browser

Категория: Здоровье и Медицина
Нажмите для полного просмотра!
UCSC Genome Browser, слайд №1UCSC Genome Browser, слайд №2UCSC Genome Browser, слайд №3UCSC Genome Browser, слайд №4UCSC Genome Browser, слайд №5UCSC Genome Browser, слайд №6UCSC Genome Browser, слайд №7UCSC Genome Browser, слайд №8UCSC Genome Browser, слайд №9UCSC Genome Browser, слайд №10UCSC Genome Browser, слайд №11UCSC Genome Browser, слайд №12UCSC Genome Browser, слайд №13UCSC Genome Browser, слайд №14UCSC Genome Browser, слайд №15UCSC Genome Browser, слайд №16UCSC Genome Browser, слайд №17UCSC Genome Browser, слайд №18UCSC Genome Browser, слайд №19UCSC Genome Browser, слайд №20UCSC Genome Browser, слайд №21UCSC Genome Browser, слайд №22UCSC Genome Browser, слайд №23UCSC Genome Browser, слайд №24UCSC Genome Browser, слайд №25UCSC Genome Browser, слайд №26UCSC Genome Browser, слайд №27UCSC Genome Browser, слайд №28UCSC Genome Browser, слайд №29UCSC Genome Browser, слайд №30UCSC Genome Browser, слайд №31UCSC Genome Browser, слайд №32UCSC Genome Browser, слайд №33UCSC Genome Browser, слайд №34UCSC Genome Browser, слайд №35UCSC Genome Browser, слайд №36UCSC Genome Browser, слайд №37UCSC Genome Browser, слайд №38UCSC Genome Browser, слайд №39UCSC Genome Browser, слайд №40UCSC Genome Browser, слайд №41UCSC Genome Browser, слайд №42
Скачать
Вы можете ознакомиться и скачать презентацию на тему UCSC Genome Browser. Доклад-сообщение содержит 42 слайдов. Презентации для любого класса можно скачать бесплатно. Если материал и наш сайт презентаций Mypresentation Вам понравились – поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте в закладки в своем браузере.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1


UCSC Genome Browser, слайд №1
Описание слайда:

Слайд 2


UCSC Genome Browser
Описание слайда:
UCSC Genome Browser

Слайд 3


UCSC Genome Browser
Описание слайда:
UCSC Genome Browser

Слайд 4


UCSC Genome Browser
Описание слайда:
UCSC Genome Browser

Слайд 5


UCSC Genome Browser
Описание слайда:
UCSC Genome Browser

Слайд 6


UCSC Genome Browser
Описание слайда:
UCSC Genome Browser

Слайд 7


Complete human genome
Описание слайда:
Complete human genome

Слайд 8


Transposable Elements 45% of the human genome is occupied by transposons and transposon-like repetitive elements. Barbara McClintock (1902-1992) in 50s. Nobel prize in 1983
Описание слайда:
Transposable Elements 45% of the human genome is occupied by transposons and transposon-like repetitive elements. Barbara McClintock (1902-1992) in 50s. Nobel prize in 1983

Слайд 9


UCSC Genome Browser, слайд №9
Описание слайда:

Слайд 10


UCSC Genome Browser, слайд №10
Описание слайда:

Слайд 11


UCSC Genome Browser, слайд №11
Описание слайда:

Слайд 12


UCSC Genome Browser, слайд №12
Описание слайда:

Слайд 13


UCSC Genome Browser, слайд №13
Описание слайда:

Слайд 14


First Layer of Genome Annotation
Описание слайда:
First Layer of Genome Annotation

Слайд 15


Epigenetics
Описание слайда:
Epigenetics

Слайд 16


Second Layer of Genome Annotation
Описание слайда:
Second Layer of Genome Annotation

Слайд 17


Second Layer of Genome Annotation
Описание слайда:
Second Layer of Genome Annotation

Слайд 18


Second Layer of Genome Annotation
Описание слайда:
Second Layer of Genome Annotation

Слайд 19


Second Layer of Genome Annotation
Описание слайда:
Second Layer of Genome Annotation

Слайд 20


Second Layer of Genome Annotation
Описание слайда:
Second Layer of Genome Annotation

Слайд 21


UCSC Genome Browser, слайд №21
Описание слайда:

Слайд 22


Data Accumulation
Описание слайда:
Data Accumulation

Слайд 23


ENCODE: Encyclopedia of DNA Elements
Описание слайда:
ENCODE: Encyclopedia of DNA Elements

Слайд 24


Digital Universe Like the Physical Universe the Digital Universe is also expanding but much faster doubling every two years – and by 2020 will be 44 zettabytes (10^ 21) Every second a new 205 000 bytes come to being At the end of this lecture the digital universe will grow by 2 214 000 000 bytes or 2.2 GB.
Описание слайда:
Digital Universe Like the Physical Universe the Digital Universe is also expanding but much faster doubling every two years – and by 2020 will be 44 zettabytes (10^ 21) Every second a new 205 000 bytes come to being At the end of this lecture the digital universe will grow by 2 214 000 000 bytes or 2.2 GB.

Слайд 25


Digital Universe
Описание слайда:
Digital Universe

Слайд 26


Что делать?
Описание слайда:
Что делать?

Слайд 27


Что получилось? (Success Stories)
Описание слайда:
Что получилось? (Success Stories)

Слайд 28


СКРЫТЫЕ ЦЕПИ МАРКОВА
Описание слайда:
СКРЫТЫЕ ЦЕПИ МАРКОВА

Слайд 29


Gene Prediction
Описание слайда:
Gene Prediction

Слайд 30


UCSC Genome Browser, слайд №30
Описание слайда:

Слайд 31


Promoter prediction Hidden Markov model with six interpolated Markov chain submodels upstream 1 and 2, TATA box, spacer, Initiator downstream. Gaussian densities of DNA physicochemical properties. Neural network classifier
Описание слайда:
Promoter prediction Hidden Markov model with six interpolated Markov chain submodels upstream 1 and 2, TATA box, spacer, Initiator downstream. Gaussian densities of DNA physicochemical properties. Neural network classifier

Слайд 32


predict tissue-dependent changes in alternative splicing for thousands of exons. predict tissue-dependent changes in alternative splicing for thousands of exons. 1,014 features: known motifs, new motifs, short motifs and features describing transcript structure trained on RNA-seq data single-layer logistic Bayesian network or neural network, or a weighted combination of single-layer decision trees.
Описание слайда:
predict tissue-dependent changes in alternative splicing for thousands of exons. predict tissue-dependent changes in alternative splicing for thousands of exons. 1,014 features: known motifs, new motifs, short motifs and features describing transcript structure trained on RNA-seq data single-layer logistic Bayesian network or neural network, or a weighted combination of single-layer decision trees.

Слайд 33


Genome intrinsic organization can explain ,50% of the in vivo nucleosome positions Genome intrinsic organization can explain ,50% of the in vivo nucleosome positions Probabilistic nucleosome–DNA interaction model - built on dinucleotide distrubution Thermodynamic model for predicting nucleosome positions genome-wide.
Описание слайда:
Genome intrinsic organization can explain ,50% of the in vivo nucleosome positions Genome intrinsic organization can explain ,50% of the in vivo nucleosome positions Probabilistic nucleosome–DNA interaction model - built on dinucleotide distrubution Thermodynamic model for predicting nucleosome positions genome-wide.

Слайд 34


UCSC Genome Browser, слайд №34
Описание слайда:

Слайд 35


UCSC Genome Browser, слайд №35
Описание слайда:

Слайд 36


UCSC Genome Browser, слайд №36
Описание слайда:

Слайд 37


UCSC Genome Browser, слайд №37
Описание слайда:

Слайд 38


We have many experimental genome-wide annotations
Описание слайда:
We have many experimental genome-wide annotations

Слайд 39


Annotations under different conditions
Описание слайда:
Annotations under different conditions

Слайд 40


Как много данных? Roadmap Epigenomics ~ 3 000 полногеномных данных ENCODE Encyclopedia of Genomic Elements ~ 9000 полногеномных данных International Cancer Genome Consortium ~ 20 000 patients (~50 типов рака) The Cancer Genome Atlas ~ patients 11 000 (~33 типа рака)
Описание слайда:
Как много данных? Roadmap Epigenomics ~ 3 000 полногеномных данных ENCODE Encyclopedia of Genomic Elements ~ 9000 полногеномных данных International Cancer Genome Consortium ~ 20 000 patients (~50 типов рака) The Cancer Genome Atlas ~ patients 11 000 (~33 типа рака)

Слайд 41


Открытые вопросы Какие участки кода работают одновременно? Как переключать режимы работы клетки? Как перепрограммируется код для разных типов тканей? Сколько механизмов регуляции существует в клетках (надежда на универсальность)?
Описание слайда:
Открытые вопросы Какие участки кода работают одновременно? Как переключать режимы работы клетки? Как перепрограммируется код для разных типов тканей? Сколько механизмов регуляции существует в клетках (надежда на универсальность)?

Слайд 42


UCSC Genome Browser, слайд №42
Описание слайда:

Скачать

Теги UCSC Genome Browser
Похожие презентации
Mypresentation.ru
Загрузить презентацию