Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей

Нажмите для полного просмотра!

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №2

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №3

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №4

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №5

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №6

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №7

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №8

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №9

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №10

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №11

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №12

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №13

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №14

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №15

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №16

Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей, слайд №17

Содержание ▲

Вы можете ознакомиться и скачать презентацию на тему Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей. Доклад-сообщение содержит 17 слайдов. Презентации для любого класса можно скачать бесплатно. Если материал и наш сайт презентаций Mypresentation Вам понравились – поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте в закладки в своем браузере.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1

Описание слайда:

Прохождение курса «Биотехнологии: генная инженерия» – источник дополнительных баллов

Слайд 2

Описание слайда:

Лекция 3 Методы чтения нуклеиновых кислот. Секвенирование геномов древних людей Методы чтения последовательностей нуклеиновых кислот Секвенирование геномов древних людей

Слайд 3

Описание слайда:

Методы прочтения последовательностей нуклеиновых кислот

Слайд 4

Описание слайда:

Секвенирование ДНК по Сэнгеру

Слайд 5

Описание слайда:

Высокопроизводительное секвенирование

Слайд 6

Описание слайда:

Задачи решаемые высоко-производительным секвенированием Определение последовательности всех хромосом организмов – секвенирование генома Определение последовательности геномов сообщества организмов – секвенирование метагенома Определение последовательности всех кодирующих областей генов - секвенирование экзома Определение последовательностей всех транскриптов (мРНК, некодирующих РНК и т.д.) - секвенирование транскриптома Выявление мутаций в раковых геномах конкретных людей  персонализированная медицина Определение дифференциально экспрессированных генов в масштабе транскриптома

Слайд 7

Описание слайда:

Виды секвенируемых нуклеиновых кислот

Слайд 8

Описание слайда:

Создание библиотек для секвенирования общие технологические шаги

Слайд 9

Описание слайда:

Технология секвенирования на примере платформы Illumina

Слайд 10

Описание слайда:

Серьезный недостаток высоко-производительного секвенирования : по концам ридов накапливаются ошибки чтения из-за неполноты химических реакций

Слайд 11

Описание слайда:

Анализ данных секвенирования Очистка данных: Удаление последовательностей адапторов Удаление ненадежно прочитанных концов ридов Удаление слишком коротких ридов Контроль качества ридов. Картирование ридов на референсную последовательность или сборка последовательностей de novo. Статистический анализ.

Слайд 12

Описание слайда:

Археогенетика Область исследований молекулярной генетики, в которой методы популяционной генетики применяются к изучению истории человечества. Термин предложен британским археологом Колином Ренфрю Ключевой метод: анализ ДНК, полученной из археологических останков (древней ДНК, англ. aDNA);

Слайд 13

Описание слайда:

Сложности секвенирования древней ДНК Высокая степень фрагментации (50 нт) Высокая степень конверсии оснований: С  U (дезаминирование цитозина с превращением в урацил) 5mC T (дезаминирование 5-метил цитозина с превращением в тимин) A  Xyp (дезаминирование аденина в гипоксантин) Алкилирование оснований Поперечные сшивки оснований Вставки митохондриальной или пластидной ДНК Большая доля примесей ДНК микроорганизмов