Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До

Нажмите для полного просмотра!

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №2

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №3

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №4

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №5

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №6

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №7

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №8

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До, слайд №9

Содержание ▲

Вы можете ознакомиться и скачать Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. До. Презентация содержит 35 слайдов. Презентации для любого класса можно скачать бесплатно. Если материал и наш сайт презентаций Вам понравились – поделитесь им с друзьями с помощью социальных кнопок и добавьте в закладки в своем браузере.

Слайды и текст этой презентации

Слайд 1

Описание слайда:

Моделирование регуляции развития меристемы побега в эмбриогенезе Arabidopsis thaliana Научный руководитель: к.б.н., доц. Лихошвай В. А. Докладчик: асп. ИЦиГ Акбердин И. Р. 3 год аспирантуры Лаборатория теоретической генетики Сектор молекулярной эволюции Специальность: 03.00.28 – биоинформатика Тема утверждена: Учёный совет, протокол №11 от 07.05.08 Межлабораторный семинар, протокол №5 от 11.04.08

Слайд 2

Описание слайда:

Слайд 3

Описание слайда:

Меристема побега Arabidopsis thaliana:

Слайд 4

Описание слайда:

Слайд 5

Описание слайда:

Цель и задачи исследования:

Слайд 6

Описание слайда:

Накопление и транспорт ауксина:

Слайд 7

Описание слайда:

Химические структуры веществ, обладающих активностью ауксина:

Слайд 8

Описание слайда:

Метаболизм ауксина:

Слайд 9

Описание слайда:

Конъюгация ауксина:

Слайд 10

Описание слайда:

Структурная модель генной сети метаболизма ауксина*:

Слайд 11

Описание слайда:

Структурная модель генной сети метаболизма ауксина:

Слайд 12

Описание слайда:

Структурная модель генной сети метаболизма ауксина:

Слайд 13

Описание слайда:

Редуцированная структурная модель генной сети метаболизма ауксина:

Слайд 14

Описание слайда:

MGSgenerator: блок автоматической конвертации формата ГС в формат моделей:

Слайд 15

Описание слайда:

MGSmodeller: Компьютерная система для конструирования, расчета и анализа моделей молекулярно-генетических систем:

Слайд 16

Описание слайда:

Результаты моделирования процентного содержания различных форм ауксина в клетке меристемы побега:

Слайд 17

Описание слайда:

Результаты моделирования динамики изменения концентрации ИУК и GH3 белка в клетке в зависимости от начальной концентрации:

Слайд 18

Описание слайда:

Результаты моделирования динамики изменения концентрации ИУК-аланин в норме и при мутациях (trp2,trp3):

Слайд 19

Описание слайда:

Эмбриональное развитие меристемы побега Arabidopsis Thaliana

Слайд 20

Описание слайда:

Разработка пространственно – распределённой модели: Основные принципы: Клетки автомата могут обмениваться химическими сигналами. Было выбрана 3 типа сигналов имеющих биологический смысл: стволовой сигнал (SS); сигнал дифференцировки (SD); базальный сигнал (BS); Все клетки разделены на несколько типов в зависимости от типа продуцируемого ими сигнала, причем клетки могут менять свой тип; Тип клетки и продолжительность клеточного цикла зависят от локальной концентрации сигналов; Направления деления зависят от градиентов распределения сигналов.

Слайд 21

Описание слайда:

Типы клеток автомата: Промеристем - клетки меристемы зародыша. Эти клетки продуцируют SS и находятся в верхней части зародыша. В процессе развития эти клетки переходят в клетки типа Л2меристеми Л3меристем. Л2меристем - клетки меристемы, находящиеся во втором слое (считая от эпидермального слоя) верхней части зародыша. Эти клетки продуцируют SS. Л3меристем - клетки, находящиеся на слой ниже клеток типа Л2меристем. Так же продуцируют SS. Транзитные - клетки, находящиеся вблизи меристемы. Они так же продуцируют низкий SD, но имеют самый высокий темп деления. Латеральные - клетки этого типа имитируют «дифференцированные» клетки, которые продуцируют SD. Суспензорные - клетки суспензора. Эти клетки продуцируют BS и располагаются в нижней части зародыша. В модели их всегда две.

Слайд 22

Описание слайда:

Внутренние параметры «клетки» модели: Type – тип клетки BS0, SS0, SD0 – значения сигналов продуцируемых данной клеткой. BS, SS, SD – значения сигналов с учетом влияния всей ткани. K – отношение стволового сигнала к сигналу дифференцировки, K=SS/SD. T – продолжительность клеточного цикла, T=T(K). Tp – возраст клетки считая от последнего деления.